1、遗传基因缺陷
夫妇任何一方有染色体异常可传至于代，染色体异常的胚胎有50%~60%发生早期自然流产。
2、环境因素
影响生殖功能的外界不良因素很多，可以直接或间接对胚胎或胎儿造成损害，过多接触某些有害的化学物质和物理因素，均可引起流产。
3、母体因素
全身性疾病，妊娠期患急性病，高热可引起子宫收缩而致流产，细菌毒素或病毒单纯疱疹病毒、巨细胞病毒等通过胎盘进入胎儿血循环，使胎儿死亡而发生流产，此外，孕妇患严重贫血或心力衰竭可致胎儿缺氧，也可能引起流产，孕妇患慢性肾炎或高血压，胎盘可能发生梗死而引起流产。
4、胎盘内分泌功能不足
妊娠早期时，卵巢的妊娠黄体分泌孕激素外，胎盘滋养细胞亦逐渐产生孕激素，妊娠8周后，胎盘逐渐成为产生孕激素的主要场所，除孕激素外，胎盘还合成其他激素如β-绒毛膜促性腺激素、胎盘生乳素及雌激素等，早孕时，上述激素值下降，妊娠将难以继续而致流产。
5、免疫因素
妊娠犹如同种异体移植，胚胎与母体间存在复杂而特殊的免疫学关系，这种关系使胚胎不被排斥，若母儿双方免疫不适应，则可引起母体对胚胎的排斥而致流产，有关免疫因素主要有父方的组织相容性抗原、胎儿特异抗原、血型抗原、母体细胞免疫调节失调、孕期母体封闭抗体不足及母体抗父方淋巴细胞的细胞毒抗体不足等。
