1、生理原因。这可能与血清中的雌醇(一种女性激素)浓度变化有关。由于女性的生理特点，在月经前后，血清中的雌二醇浓度降低，引起颅内外血管及子宫血管对某些因素更敏感，从而引起血管张力的变化，使一部分敏感的患者发生头痛，月经后，血清中雌二醇浓度回复至正常，病人的头痛亦可缓解。还有一种可能性存在，雌激素(包括雌二醇)可通过刺激泌乳素分泌，进而直接或间接地刺激前列腺素分泌，而前列腺素作用于血管，引起血管的收缩和扩张，这种变化由于雌激素的影响也呈现周期的变化，从而激发头痛发作。
2、生活习惯。平常缺少运动，睡眠时间不足，生活没有规律，饮食不规范等都会导致经期头痛。
3、环境因素。电磁辐射、电视屏幕、镁光灯、强力阳光等，这些因素会使人的眼睛疲劳引发头痛。
4、精神压力。在工作中难免遇到一些不顺心的事或一些棘手的问题，加上现代都市紧张的生活和工作压力，使大脑神经处于紧张状态，容易导致女性精神压力很大，从而影响月经正常，甚至因此引起经期头痛。
5、遗传因素。经期偏头痛通常有家族性倾向，专家认为这可能与遗传有关。
