验孕笔失效可以两种型态表示：
1、已怀孕，但验出来显示没有怀孕，即验孕笔不够敏感：可能的原因包括验孕笔过期、药剂已失效；另一种原因是厂商使用的药剂有问题。
2、未怀孕，但验出来显示有怀孕，即验孕笔试剂太灵敏：女性怀孕时体内的绒毛腺性激素会升高，可经由尿液验出，验孕笔就是在测试体内的绒毛腺性激素。但绒毛腺性激素存在于每一个人体内（包括男性），只是量较少。有些试剂因为太敏感，即使量少也可能呈阳性反应，而让使用者误以为怀孕了。
验孕棒的最佳使用时间是什么时候？太早验与太晚验，都可能使检验结果不正确。有些人在行房后2～3天就检验，往往验不出正确的结果。有些人则在怀孕一段时间后才验，然而因为绒毛腺性激素值会随着怀孕周数增加而增加，例如10周后，数值即可能达到10万以上，而一般的验孕笔在超过一定的数值后即验不出来。
如何正确验孕？
如果对于验孕笔标示的结果有怀疑，最好使用两个厂牌的验孕笔。另外更可以到妇产科检查，妇产科医师觉得有怀疑时，会使用不同的试剂或是将尿液稀释来检验，必要时还可以抽血检查。另外，怀孕大约到6周（从上次月经来时第一天算起）以后，可以用超声波看看胚胎是否位于子宫内。虽然验孕笔的准确度极高，但并非百分之百，需要仔细地确认，以免有使用验孕笔呈阴性却已怀孕，在误判的情况下而服用药物、做放射性检查，而后来知道怀孕之后，造成终日惶惶不安的遗憾。
