一般儿童强直性脊柱炎患者早晨起床时背部会感觉僵硬不适，久卧或久坐起立会出现晨僵或疼痛症状。其次儿童强直性脊柱炎在慢性发病一般呈现为低热症状，体重明显减轻，全身疲乏，局部肌肉萎缩，多伴有严重的外周大关节和中轴关节症状，以髋关节炎最为多见。
在急性发病期会出现高热，高热症状呈阶段性。不过一般不影响胸廓活动度，呼吸没有改变。出现反复性的虹膜炎症状，这是儿童强直性脊柱炎的典型症状，早期虹膜炎可以是强直性脊柱炎惟一表示，表示为单侧眼红、痛、畏光、黑朦等，可以先后累及双眼，轻重交替呈现，继续时间一般为4-6周，虹膜炎一般无后遗症。
儿童强直性脊柱炎是脊椎的骨质、惟间盘、韧带、肌肉发生病变，进而压迫、牵引刺激脊髓、脊神经、血管、植物神经从而出现复杂多样的症状。像颈椎病、腰椎病的某些症状还是很相似的。所以一旦误诊，会造成严重的后果，甚至严重者可能导致瘫痪。
